MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 97244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009484	CGA	2	6	39589	39594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259061
1002	NC_009484	GTC	2	6	39676	39681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259062
1003	NC_009484	GGC	2	6	39688	39693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259062
1004	NC_009484	GGCG	2	8	39696	39703	0 %	0 %	75 %	25 %	148259062
1005	NC_009484	CAG	2	6	39721	39726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259062
1006	NC_009484	CCG	2	6	39729	39734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259062
1007	NC_009484	GC	3	6	39741	39746	0 %	0 %	50 %	50 %	148259062
1008	NC_009484	CAG	2	6	39754	39759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259062
1009	NC_009484	GACCG	2	10	39784	39793	20 %	0 %	40 %	40 %	148259062
1010	NC_009484	CGG	3	9	39825	39833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259062
1011	NC_009484	GGT	2	6	39850	39855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259062
1012	NC_009484	CGG	2	6	39864	39869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259062
1013	NC_009484	CG	4	8	39893	39900	0 %	0 %	50 %	50 %	148259062
1014	NC_009484	GC	3	6	39986	39991	0 %	0 %	50 %	50 %	148259062
1015	NC_009484	CAG	2	6	39994	39999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259062
1016	NC_009484	GCCG	2	8	40035	40042	0 %	0 %	50 %	50 %	148259062
1017	NC_009484	GCCC	2	8	40068	40075	0 %	0 %	25 %	75 %	148259062
1018	NC_009484	GCA	4	12	40212	40223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259062
1019	NC_009484	GGTG	2	8	40227	40234	0 %	25 %	75 %	0 %	148259062
1020	NC_009484	CCA	2	6	40257	40262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259062
1021	NC_009484	CGG	2	6	40296	40301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259062
1022	NC_009484	CGGCG	2	10	40309	40318	0 %	0 %	60 %	40 %	148259062
1023	NC_009484	GCC	2	6	40375	40380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259062
1024	NC_009484	GCC	2	6	40485	40490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259063
1025	NC_009484	AGA	2	6	40604	40609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259063
1026	NC_009484	GTG	2	6	40618	40623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259063
1027	NC_009484	CCG	2	6	40628	40633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259063
1028	NC_009484	GGC	2	6	40634	40639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259063
1029	NC_009484	GGC	2	6	40674	40679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259063
1030	NC_009484	GCG	2	6	40684	40689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259063
1031	NC_009484	CCGC	2	8	40697	40704	0 %	0 %	25 %	75 %	148259063
1032	NC_009484	ACGCCG	2	12	40735	40746	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148259063
1033	NC_009484	GCA	2	6	40763	40768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259063
1034	NC_009484	AGA	2	6	40787	40792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259063
1035	NC_009484	GATC	2	8	40802	40809	25 %	25 %	25 %	25 %	148259063
1036	NC_009484	CGG	2	6	40811	40816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259063
1037	NC_009484	CCTCGT	2	12	40838	40849	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148259063
1038	NC_009484	GGCA	2	8	40858	40865	25 %	0 %	50 %	25 %	148259063
1039	NC_009484	CGA	2	6	40877	40882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259063
1040	NC_009484	CG	3	6	40897	40902	0 %	0 %	50 %	50 %	148259063
1041	NC_009484	GGC	2	6	40911	40916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259063
1042	NC_009484	GC	3	6	40915	40920	0 %	0 %	50 %	50 %	148259063
1043	NC_009484	TCGC	2	8	40921	40928	0 %	25 %	25 %	50 %	148259063
1044	NC_009484	CGC	2	6	41043	41048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_009484	AGC	2	6	41071	41076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_009484	GGC	2	6	41104	41109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259064
1047	NC_009484	CGC	2	6	41122	41127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259064
1048	NC_009484	CTT	3	9	41152	41160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259064
1049	NC_009484	GCC	2	6	41207	41212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259064
1050	NC_009484	CAG	2	6	41365	41370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259064
1051	NC_009484	GC	3	6	41386	41391	0 %	0 %	50 %	50 %	148259064
1052	NC_009484	GGC	2	6	41392	41397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259064
1053	NC_009484	CGG	2	6	41407	41412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259064
1054	NC_009484	GTCGGC	2	12	41425	41436	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148259064
1055	NC_009484	GCG	2	6	41451	41456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259064
1056	NC_009484	GGC	2	6	41485	41490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259064
1057	NC_009484	CGT	2	6	41559	41564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259064
1058	NC_009484	GGCCG	2	10	41590	41599	0 %	0 %	60 %	40 %	148259064
1059	NC_009484	CCG	2	6	41621	41626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259064
1060	NC_009484	TGG	2	6	41723	41728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259064
1061	NC_009484	GGC	2	6	41731	41736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259064
1062	NC_009484	CTT	2	6	41794	41799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259064
1063	NC_009484	CG	3	6	41811	41816	0 %	0 %	50 %	50 %	148259064
1064	NC_009484	GCG	3	9	41814	41822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259064
1065	NC_009484	GGC	2	6	41839	41844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259064
1066	NC_009484	TCG	2	6	41849	41854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259064
1067	NC_009484	GCC	2	6	41935	41940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259064
1068	NC_009484	CCG	2	6	41978	41983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259064
1069	NC_009484	GAG	2	6	41999	42004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259064
1070	NC_009484	GC	3	6	42042	42047	0 %	0 %	50 %	50 %	148259064
1071	NC_009484	CAG	2	6	42079	42084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259064
1072	NC_009484	GCG	2	6	42090	42095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259064
1073	NC_009484	CTT	2	6	42166	42171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259064
1074	NC_009484	GAA	2	6	42193	42198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259064
1075	NC_009484	ATG	2	6	42200	42205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259064
1076	NC_009484	AGC	2	6	42215	42220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259064
1077	NC_009484	CG	3	6	42223	42228	0 %	0 %	50 %	50 %	148259064
1078	NC_009484	AGCCG	2	10	42243	42252	20 %	0 %	40 %	40 %	148259064
1079	NC_009484	GTGC	2	8	42267	42274	0 %	25 %	50 %	25 %	148259064
1080	NC_009484	GTC	2	6	42458	42463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259064
1081	NC_009484	CCG	2	6	42521	42526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259064
1082	NC_009484	CGC	2	6	42591	42596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259064
1083	NC_009484	CGC	2	6	42673	42678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259064
1084	NC_009484	CGTCGG	2	12	42679	42690	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148259064
1085	NC_009484	GCC	2	6	42697	42702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259064
1086	NC_009484	CCT	2	6	42705	42710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259064
1087	NC_009484	CAATG	2	10	42748	42757	40 %	20 %	20 %	20 %	148259064
1088	NC_009484	GGC	2	6	42766	42771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259064
1089	NC_009484	GCG	2	6	42784	42789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259064
1090	NC_009484	T	6	6	42800	42805	0 %	100 %	0 %	0 %	148259064
1091	NC_009484	TGAT	2	8	42887	42894	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_009484	ACCGA	2	10	42921	42930	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1093	NC_009484	AGC	2	6	43007	43012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_009484	CCA	2	6	43055	43060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_009484	GCC	2	6	43091	43096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_009484	GCC	2	6	43176	43181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_009484	TCAT	2	8	43206	43213	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1098	NC_009484	TCG	2	6	43334	43339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_009484	GCC	2	6	43361	43366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259065
1100	NC_009484	GGC	2	6	43402	43407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259065
1101	NC_009484	CAT	2	6	43420	43425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259065
1102	NC_009484	ATC	2	6	43568	43573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259065
1103	NC_009484	CT	3	6	43589	43594	0 %	50 %	0 %	50 %	148259065
1104	NC_009484	CAG	2	6	43636	43641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259065
1105	NC_009484	CGCGC	2	10	43665	43674	0 %	0 %	40 %	60 %	148259065
1106	NC_009484	CGG	2	6	43691	43696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259065
1107	NC_009484	GCC	2	6	43709	43714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259065
1108	NC_009484	GGT	2	6	43738	43743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259065
1109	NC_009484	GCCG	2	8	43753	43760	0 %	0 %	50 %	50 %	148259065
1110	NC_009484	GCC	2	6	43807	43812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259065
1111	NC_009484	GAT	2	6	43846	43851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259065
1112	NC_009484	TCG	2	6	43928	43933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259065
1113	NC_009484	ATC	2	6	44027	44032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259065
1114	NC_009484	CCG	2	6	44043	44048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259065
1115	NC_009484	GCC	2	6	44051	44056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259065
1116	NC_009484	CGC	2	6	44110	44115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259065
1117	NC_009484	GCC	2	6	44119	44124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259065
1118	NC_009484	CGA	2	6	44133	44138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259065
1119	NC_009484	CAG	2	6	44242	44247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259065
1120	NC_009484	GCG	2	6	44270	44275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259065
1121	NC_009484	GAG	2	6	44306	44311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259065
1122	NC_009484	GCC	2	6	44329	44334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259065
1123	NC_009484	GGCGCC	2	12	44335	44346	0 %	0 %	50 %	50 %	148259065
1124	NC_009484	GC	3	6	44353	44358	0 %	0 %	50 %	50 %	148259065
1125	NC_009484	TCGA	2	8	44363	44370	25 %	25 %	25 %	25 %	148259065
1126	NC_009484	GCG	2	6	44506	44511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259065
1127	NC_009484	CGGC	2	8	44516	44523	0 %	0 %	50 %	50 %	148259065
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1380	NC_009484	CATG	2	8	54314	54321	25 %	25 %	25 %	25 %	148259073
1381	NC_009484	CGG	2	6	54347	54352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259073
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